利用病例-父母設(shè)計(jì)的候選疾病易感基因的LOD值排除分析

已有的一種LOD值排除方法,可在隨機(jī)群體樣本中反過來檢測(cè)引起復(fù)雜疾病和數(shù)量特征的候選基因的重要性.LOD值排除方法是常規(guī)關(guān)聯(lián)分析的有效補(bǔ)充.雖然與傳統(tǒng)的關(guān)聯(lián)分析相比,方法更加保守,但是仍然受到群體分層的影響.為了控制群體異質(zhì)性所帶來的混雜影響,文中通過病例-父母設(shè)計(jì),發(fā)展了一種LOD值排除分析方法.這種方法與連鎖分析中的排除分析是相似的.觀測(cè)到的核心家系數(shù)據(jù)的似然函數(shù)可以構(gòu)建多項(xiàng)分布式:L=n!/Ⅱi,j nij! Ⅱi,j(pij)nij.其中nij是父母配對(duì)類型為i而受累子代的基因型為j的家庭個(gè)數(shù),pij為有一個(gè)受累子代的核心家庭中父母配對(duì)類型是i而受累子代的基因型為j的核心家庭的條件概率.這個(gè)似然值是基因頻率和被檢測(cè)遺傳標(biāo)記的相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)的函數(shù).在這種方法中,能夠分析候選基因的特定遺傳效應(yīng)和遺傳模型.如果LOD值≤-2.0,檢測(cè)位點(diǎn)沒有含有比特定位點(diǎn)更大的效應(yīng)而被排除.我們進(jìn)行了模擬研究來檢測(cè)排除分析中遺傳效應(yīng)和遺傳模型的功效.模擬表明,這種方法有一定的合理功效來排除一個(gè)具很小遺傳效應(yīng)的候選基因.與核心家系中傳遞不平衡檢驗(yàn)(TDT)關(guān)聯(lián)分析相似的是,該排除分析一般不受群體混層的影響.排除分析可以作為排除不含有或者含很小遺傳效應(yīng)的候選基因的TDT分析方法的補(bǔ)充.這種方法已經(jīng)被用來檢測(cè)維生素D受體對(duì)骨質(zhì)疏松癥的重要性.

作 者： 鄧紅文 高桂民   作者單位： 鄧紅文(湖南師范大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院 蛋白質(zhì)化學(xué)與發(fā)育生物學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 分子與統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)研究室,長(zhǎng)沙 410081;Department of Orthopedic Surgery, School of Medicine, University of Missouri-Kansas City, 2411 Holmes Street, Kansas City, MO 64108, USA)

高桂民(Virginia Bioinformatics Institute and Department of Statistics, Virginia Polytechnic Institute and State University Blacksburg VA 24061-0315, USA) 

刊 名： 自然科學(xué)進(jìn)展  ISTIC PKU 英文刊名： PROGRESS IN NATURAL SCIENCE  年，卷(期)： 2006 16(5)  分類號(hào)： N1  關(guān)鍵詞： 關(guān)聯(lián)研究   候選基因   病例-父母設(shè)計(jì)   疾病易感位點(diǎn)   排除定位   LOD值  

【利用病例-父母設(shè)計(jì)的候選疾病易感基因的LOD值排除分析】相關(guān)文章：

商的近似值的教學(xué)設(shè)計(jì)04-25

數(shù)學(xué)教材分析，學(xué)情分析，教學(xué)設(shè)計(jì)04-25

教學(xué)設(shè)計(jì)案例分析的應(yīng)用04-25

電腦未接地導(dǎo)致使用前置USB時(shí)死機(jī)的故障分析和排除經(jīng)過04-18

基因分身藥水作文11-17

利用FPGA實(shí)現(xiàn)MMC2107與SDRAM接口設(shè)計(jì)論文12-02

三九天如何排除寒氣12-18

魏氏梭菌病的病例治療體會(huì)04-25

大隊(duì)委候選人作文11-09

GM food 轉(zhuǎn)基因食品05-04