支持向量機(jī)及組合預(yù)測(cè)在蛋白質(zhì)四級(jí)結(jié)構(gòu)分類中的應(yīng)用

目的:基于支持向量機(jī)建立一個(gè)自動(dòng)化識(shí)別新肽鏈四級(jí)結(jié)構(gòu)的方法,提高現(xiàn)有方法的識(shí)別精度.方法:改進(jìn)4種已有的蛋白質(zhì)一級(jí)序列特征值提取方法,采用線性和非線性組合預(yù)測(cè)方法建立一個(gè)有效的組合預(yù)測(cè)模型.結(jié)果:以同源二聚體及非同源二聚體為例.對(duì)4種特征值提取方法進(jìn)行改進(jìn)后其分類精度均提升了2～3%;進(jìn)一步實(shí)施線性與非線性組合預(yù)測(cè)后,其分類精度再次提高了2～3%,使獨(dú)立測(cè)試集的分類精度達(dá)到了90%以上.結(jié)論:4種特征值提取方法均較好地反應(yīng)出蛋白質(zhì)一級(jí)序列包含四級(jí)結(jié)構(gòu)信息,組合預(yù)測(cè)方法能有效地集多種特征值提取方法優(yōu)勢(shì)于一體.

作 者： 譚顯勝 袁哲明 周鐵軍 熊潔儀 王春娟 TAN Xian-shen YUAN Zhe-ming ZHOU Tie-jun XIO NG Jie-yi WANG Chun-juan   作者單位： 譚顯勝,TAN Xian-shen(湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)生物安全科學(xué)技術(shù)學(xué)院,湖南,長沙,410128;湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)理學(xué)院,湖南,長沙,410128)

袁哲明,熊潔儀,王春娟,YUAN Zhe-ming,XIO NG Jie-yi,WANG Chun-juan(湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)生物安全科學(xué)技術(shù)學(xué)院,湖南,長沙,410128)

周鐵軍,ZHOU Tie-jun(湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)理學(xué)院,湖南,長沙,410128) 

刊 名： 現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展  ISTIC 英文刊名： PROGRESS IN MODERN BIOMEDICINE  年，卷(期)： 2008 8(4)  分類號(hào)： Q518-3  關(guān)鍵詞： 蛋白質(zhì)四級(jí)結(jié)構(gòu)   分類   支持向量機(jī)   組合預(yù)測(cè)  

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