基于氨基酸特征序列的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析

針對蛋白質(zhì)序列中氨基酸的核苷酸組成部分及其相關(guān)特征信息,提出另外的σ-等序列的概念,并討論了其主要特征與次要特征,可作為對蛋白質(zhì)進行定性和定量比較的一種方法,用來判斷這些物種的同源性和相似性程度.然后,對所取的全α螺旋,全β折疊和αβ類序列,利用σ-,τ-,στ靠序列的概念,給出蛋白質(zhì)序列的相關(guān)氨基酸特征序列.同時對三類共18個蛋白質(zhì)序列進行數(shù)值刻劃,給出數(shù)值刻劃圖并進行分析.

作 者： 朱平 管維紅 高雷 徐振源 ZHU Ping GUAN Wei-hong GAO Lei XU Zhen-yuan   作者單位： 朱平,ZHU Ping(江南大學理學院,江蘇,無錫,214122;江南大學信息工程學院,江蘇,無錫,214122)

管維紅,高雷,徐振源,GUAN Wei-hong,GAO Lei,XU Zhen-yuan(江南大學理學院,江蘇,無錫,214122) 

刊 名： 生物信息學  ISTIC 英文刊名： CHINA JOURNAL OF BIOINFORMATICS  年，卷(期)： 2008 6(3)  分類號： Q518.1 O15 TP391  關(guān)鍵詞： 特征序列   同義密碼子   蛋白質(zhì)序列   數(shù)值刻劃圖  

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