人類群體遺傳結構的雙標圖模型及其應用

提出了分析人類群體遺傳結構的PPG雙標圖模型的基本原理及其應用.PPG雙標圖根據人類群體遺傳學的基本原理,利用矩陣奇異值分解技術,將多維基因頻率矩陣近似為一個能夠用雙標圖表示的二維矩陣,從而實現了人類群體遺傳結構的圖形化和可視化直觀分析.它與聚類分析、主成分分析、對應分析等傳統(tǒng)多元統(tǒng)計分析方法相比,具有明顯的優(yōu)越性.PPG雙標圖通過其幾何性質,反映了其豐富的群體遺傳學含義;更重要的是,在基因頻率矩陣前2項奇異值的累計貢獻率足夠大的前提下,利用雙標圖,以輔助線為補充,可以實現人類群體遺傳結構的可視化直觀定量分析:①比較各群體之間的遺傳距離,劃分群體類型;②比較各基因的變異性大小;③分析各基因之間的相關性;④比較某基因對各亞群體遺傳結構的相對貢獻;⑤比較任意2個亞群體遺傳結構的差異;⑥分析任意2個基因的差異及其對各亞群體變異性的貢獻;⑦分析群體與基因的交互作用及其對群體亞分的貢獻.因此,PPG雙標圖值得在人類群體遺傳結構分析中推廣應用,但PPG雙標圖也存在一定的局限性.

作 者： 薛付忠 王潔貞 郭亦壽 胡平 XUE Fu-zhong WANG Jie-zhen GUO Yi-shou HU Ping   作者單位： 薛付忠,王潔貞,胡平,XUE Fu-zhong,WANG Jie-zhen,HU Ping(山東大學公共衛(wèi)生學院流行病學與醫(yī)學統(tǒng)計學研究所,濟南,250012)

郭亦壽,GUO Yi-shou(山東大學醫(yī)學院醫(yī)學遺傳學研究所,濟南,250012) 

刊 名： 科技導報  ISTIC PKU 英文刊名： SCIENCE & TECHNOLOGY REVIEW  年，卷(期)： 2006 24(5)  分類號： Q347 R394.5  關鍵詞： 人類群體遺傳結構   PPG雙標圖模型   HLA-A基因座   漢族群體  

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