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一個(gè)水稻穗特異表達(dá)鋅指蛋白基因的克隆與結(jié)構(gòu)分析

時(shí)間:2023-04-29 14:36:27 生物醫(yī)學(xué)論文 我要投稿
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一個(gè)水稻穗特異表達(dá)鋅指蛋白基因的克隆與結(jié)構(gòu)分析

利用生物信息學(xué)和RT-PCR方法從水稻中克隆鑒定了一個(gè)新的具有TFⅢA型鋅指結(jié)構(gòu)的鋅指蛋白基因,其開(kāi)放閱讀框?yàn)?092 bp,編碼363個(gè)氨基酸殘基.組織表達(dá)譜結(jié)果表明,該基因只在水稻幼穗組織中表達(dá),在成株期的根、葉、莖以及花藥中不表達(dá),將其命名為OsZPT3-1.序列分析表明OsZPT3-1具有3個(gè)C2H2型鋅指結(jié)構(gòu),在氨基酸的C端沒(méi)有典型的轉(zhuǎn)錄抑制區(qū)域DLN-box,但LXLXL的結(jié)構(gòu)仍然表明OsZPT3-1可能是一個(gè)轉(zhuǎn)錄抑制因子.對(duì)OsZPT3-1啟動(dòng)子區(qū)域進(jìn)行預(yù)測(cè),結(jié)果發(fā)現(xiàn)3個(gè)MADS-box轉(zhuǎn)錄因子識(shí)別位點(diǎn),推測(cè)OsZPT3-1可能在MADS-box轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)節(jié)下,通過(guò)抑制下游基因的表達(dá)在水稻穗部器官的生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中發(fā)揮重要的調(diào)控作用.

作 者: 李余生 黃驥 禹山林 侯夫云 張紅生 LI Yu-sheng HUANG Ji YU Shan-lin HOU Fu-yun ZHANG Hong-sheng   作者單位: 南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 作物遺傳與種質(zhì)創(chuàng)新國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,江蘇 南京 210095  刊 名: 中國(guó)水稻科學(xué)  ISTIC PKU 英文刊名: CHINESE JOURNAL OF RICE SCIENCE  年,卷(期): 2006 20(4)  分類(lèi)號(hào): Q943.2 S511.032  關(guān)鍵詞: 水稻   鋅指蛋白   基因克隆   表達(dá)分析  

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