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遼寧堿蓬甜菜堿醛脫氫酶基因(BADH)啟動(dòng)子分離及序列分析

時(shí)間:2023-04-27 21:39:38 生物醫(yī)學(xué)論文 我要投稿
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遼寧堿蓬甜菜堿醛脫氫酶基因(BADH)啟動(dòng)子分離及序列分析

根據(jù)已知的遼寧堿蓬BADH cDNA 5'端序列設(shè)計(jì)兩個(gè)基因特異的反向引物(BR1,BR2),通過銜接頭PCR獲得了BADH基因起始密碼子上游265 bp的序列.根據(jù)所獲得的序列設(shè)計(jì)兩個(gè)基因特異的反向引物(BR3,BR4),用BR2、BR3、BR4分別與4個(gè)簡(jiǎn)并引物配對(duì),通過TAIL-PCR擴(kuò)增,獲得了約2kb的序列.經(jīng)Sequencer軟件拼接上述兩段序列,獲得了BADH基因起始密碼子上游2055 bp的序列.用TSSP-TCM軟件分析此序列,預(yù)測(cè)出轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)(T)位于起始密碼子上游62 bp處,由此獲得了1993 bp的SlBADH啟動(dòng)子序列.用PLACE軟件分析此序列,發(fā)現(xiàn)該序列具有啟動(dòng)子的基本元件TATA-box、CAAT-box,包含多個(gè)脅迫誘導(dǎo)元件,如鹽誘導(dǎo)元件GAAAAA,抗凍、缺水、脫落酸、抗寒元件CANNTG,傷害誘導(dǎo)元件ANATFNCNN,熱激元件ATAAATGT等,是一個(gè)強(qiáng)的脅迫誘導(dǎo)啟動(dòng)子.

作 者: 李秋莉 張毅 尹輝 李丹 LI Qiu-Li ZHANG Yi YIN Hui LI Dan   作者單位: 遼寧師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,大連,116029  刊 名: 生物工程學(xué)報(bào)  ISTIC PKU 英文刊名: CHINESE JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY  年,卷(期): 2006 22(1)  分類號(hào): Q781  關(guān)鍵詞: 遼寧堿蓬   甜菜堿醛脫氫酶   啟動(dòng)子   序列分析  

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