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Armillariella tabescens阿拉伯糖苷酶基因全長(zhǎng)cDN

時(shí)間:2023-04-26 19:39:46 生物醫(yī)學(xué)論文 我要投稿
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Armillariella tabescens阿拉伯糖苷酶基因全長(zhǎng)cDNA的克隆與表達(dá)

通過對(duì)假密環(huán)菌(Armillariella tabescens)的表達(dá)cDNA克隆文庫進(jìn)行隨機(jī)測(cè)序,獲得一段與多形擬桿菌的阿拉伯糖苷酶序列同源性很高的EST序列(AJ620046).根據(jù)獲得的EST序列用SMART-RACE技術(shù)成功從假密環(huán)菌中克隆出了阿拉伯糖苷酶基因的全長(zhǎng)cDNA,用生物信息學(xué)的方法對(duì)所獲的序列進(jìn)行信息學(xué)分析.分析結(jié)果顯示其全長(zhǎng)cDNA為1 016 bp,其最長(zhǎng)的開放閱讀框架為924 bp,編碼307個(gè)氨基酸,該全長(zhǎng)cDNA序列與多形擬桿菌的阿拉伯糖苷酶序列具有較高同源性,80~279位氨基酸序列屬于阿拉伯糖苷酶超家族,58~184位氨基酸是一個(gè)典型的結(jié)構(gòu)功能域,蛋白分子質(zhì)量預(yù)測(cè)為32 881 u,等電點(diǎn)為4.59.構(gòu)建重組質(zhì)粒pPIC9-AF,并在畢赤酵母菌GS115中對(duì)所獲得的基因進(jìn)行了表達(dá),相對(duì)酶活達(dá)到了81.25%.

作 者: 謝春芳 黃輝 姚冬生 劉大嶺 梁郁強(qiáng) XIE Chun-fang HUANG Hui YAO Dong-sheng LIU Da-ling LIANG Yu-qiang   作者單位: 暨南大學(xué)生物工程學(xué)系,廣東,廣州,510632  刊 名: 暨南大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)與醫(yī)學(xué)版)  ISTIC PKU 英文刊名: JOURNAL OF JINAN UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE & MEDICINE EDITION)  年,卷(期): 2006 27(3)  分類號(hào): Q7  關(guān)鍵詞: 假密環(huán)菌   阿拉伯糖苷酶   生物信息學(xué)  

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