杯果木CCR基因克隆和同源進化分析

從粗毛杯果木和軟葉杯果木基因組中克隆CCR基因,經測序驗證擴增片斷長度均為2321 bp,包含部分外顯子3、4和部分5,以及內含子3和4.同源性比較分析表明:租毛杯果木與傘房屬樹種CCR的同源相似性達到98%～87%,與桉屬樹種CCR的同源相似性達到97%～84%;而軟葉杯果木與傘房屬樹種CCR的同源相似性達到98%～87%,與桉屬樹種CCR的同源相似性達到95%～84%.總體上,該2個杯果木樹種與傘房屬CCR同源相似性較高,而與桉屬CCR同源相似性較低.3個屬中最長保守序列位于Exon5的第3147～3175位點,共29個堿基.保守區(qū)域主要集中于Exon 5,少數(shù)于Intron4.桉屬總變異率大于杯果木屬和傘房屬.桉屬Exon 4變異率大于屬內其它Exon或Intron;同樣發(fā)現(xiàn)Exon 4的簡約信息位點百分數(shù)大于屬內其它Exon或Intron,但杯果木屬中的Intron 3變異率高于屬內其它Exon或Intron.傘房屬以Exon 5的變異率最高.Exon或Intron平均變異率均以桉屬最多,其次是杯果木屬,最少的是傘房屬.使用MEGA3.1軟件構建的CCR進化樹表明,桉屬、傘房屬和杯果木屬分別形成單系,其親緣關系可以明顯區(qū)分開來.杯果木屬最早產生分歧,并形成單獨一個分枝;其次是傘房屬,也形成單獨-個分枝,進化較杯果木屬遲;最遲進化的是桉屬,也形成單獨一個分枝.這種結果與形態(tài)學比較接近,易為人們所接受.

作 者： 陳碧華 CHEN Bi-hua   作者單位： 福建省林業(yè)科學研究院,福建,福州,350012  刊 名： 桉樹科技  英文刊名： EUCALYPT SCIENCE & TECHNOLOGY  年，卷(期)： 2009 26(1)  分類號： S792.39  關鍵詞： 粗毛杯果木   軟葉杯果木   CCR基因   基因克隆   同源性   分子進化  

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