大白菜EST-SSR標(biāo)記開發(fā)中非SSR標(biāo)記的鑒別

EST-SSR標(biāo)記開發(fā)過程中經(jīng)常會(huì)遇到一些問題,例如引物重復(fù)設(shè)計(jì)等.本試驗(yàn)對(duì)從大白菜EST序列中開發(fā)的30個(gè)多態(tài)性SSR標(biāo)記產(chǎn)生的多態(tài)性條帶進(jìn)行測(cè)序,結(jié)果發(fā)現(xiàn)有一些標(biāo)記的多態(tài)性并不是由于其所含有的簡(jiǎn)單重復(fù)序列重復(fù)次數(shù)的改變引起的,這類標(biāo)記約占鑒定標(biāo)記總數(shù)的13%.這些標(biāo)記實(shí)際上屬于EST-SCAR標(biāo)記.在進(jìn)行SSR變異對(duì)基因表達(dá)及功能影響方面的研究時(shí),這類非SSR標(biāo)記應(yīng)該被排除.

作 者： 周新成 劉立峰 李化銀 高建偉   作者單位： 山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所,山東,濟(jì)南,250100  刊 名： 山東農(nóng)業(yè)科學(xué)  ISTIC 英文刊名： SHANDONG AGRICULTURAL SCIENCES  年，卷(期)： 2010 ""(4)  分類號(hào)： S634.1 Q503  關(guān)鍵詞： EST-SSR   標(biāo)記開發(fā)   多態(tài)性   測(cè)序   大白菜  

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